El banco de germoplasma almacena in vitro un elevado número de muestras de interés (gametos, embriones y células somáticas), como consecuencia de la participación del INIA desde hace más de 50 años en proyectos de conservación de especies silvestres y razas autóctonas en peligro de extinción, así como de su labor investigadora en la mejora genética y reproductiva de especies de interés agroalimentario.
Así mismo, el INIA dispone de recursos zoogenéticos in vivo conservados en la finca avícola El Encín (Alcalá de Henares, Madrid) y en el Centro Nacional de Investigación y Desarrollo del Cerdo Ibérico de Zafra (Badajoz), así como en la finca El Dehesón del Encinar (Oropesa, Toledo), propiedad de la Junta de Castilla-La Mancha, en la que se encuentra la piara ibérica conservada.
